Sarkofag z czarnego marmuru stanął w miejscu, gdzie jeszcze do niedawna spoczywały szczątki św. abp. Szczęsnego-Felińskiego, poprzednika kard. Józefa Glempa. Prymas senior był zafascynowany jego postacią.
Sarkofag kard. Józefa Glempa stanął obok miejsc doczesnego spoczynku arcybiskupów Antoniego Melchiora Fijałkowskiego i Wincentego Teofila Popiela. Został umieszczony w miejscu, gdzie do 2003 r. znajdowały się szczątki św. abp. Zygmunta Szczęsnego-Felińskiego, arcybiskupa warszawskiego w latach 1862–1883, które po beatyfikacji w 2003 r. zostały złożone w Kaplicy Literackiej.
Prymas kard. Józef Glemp został pochowany w trumnie z drewna dębowego. W środku ma ona wkład metalowy. Ciało Prymasa zostało pochowane w sutannie kardynalskiej, na którą założono strój liturgiczny – albę i ornat. Jego głowę zdobiły piuska i biała mitra, a ramiona – paliusz metropolity. Na piersiach miał swój krzyż biskupi, a u stóp – biret kardynalski.
Na płycie nagrobnej zostały wyryte krzyż oraz napisy: „Józef Kardynał Glemp 18.12.1929 – 23.1.2013”, „Prymas Polski 7.7.1981 – 18.12.2009”, „Arcybiskup Metropolita Warszawski 7.7.1981 – 5.1.2007”, „Metropolita Gnieźnieński 7.7.1981 – 25.3.1992”.
Podziemia katedry zostały wyremontowane pod koniec XX wieku. Spoczywają tu prochy znamienitych ludzi polskiej historii, wśród nich: książęta mazowieccy z rodu Piastów, król Stanisław August Poniatowski, prezydenci Rzeczypospolitej Polskiej Gabriel Narutowicz i Ignacy Mościcki, generał Kazimierz Sosnkowski, wielki pisarz, laureat Nagrody Nobla Henryk Sienkiewicz oraz muzyk i mąż stanu Ignacy Jan Paderewski.
W archikatedrze spoczywają również słudzy Boży prymas August Hlond oraz prymas Stefan Wyszyński.