Na ekspozycji zgromadzono także pamiątki związane z Karolem Wojtyłą. Prezentowane są dzieła sztuki: obrazy, rzeźby, przedmioty kultu, które były papieskimi darami dla Polski, i te, które mu ofiarowywano. Wśród eksponatów można zobaczyć rozprawę doktorską ks. Karola Wojtyły na temat wiary u św. Jana od Krzyża, a także sprawdzić, jakie oceny miał w indeksie z Uniwersytetu św. Tomasza z Akwinu, „Angelicum”.

Zobaczyć można też sutannę młodego ks. Karola oraz jego późniejsze szaty biskupie i kardynalskie. Wśród szczególnych pamiątek znajdą się jego rękopisy: życiorys, napisany w 1951 r., oraz odnaleziony niedawno cykl 13 katechez „Kazanie na Areopagu”, użyczony na wystawę przez kard. Stanisława Dziwisza. Moment wyboru na Stolicę Piotrową obrazować będzie rysunek przypisywany Rafaelowi Santi „Wręczenie kluczy św. Piotrowi przez Chrystusa”.