Kiedy bierze się do ręki dziś, po 360 latach, opis jego męczeństwa, wciąż trudno to czytać. Tak okrutna była to śmierć, którą zadali mu ludzie z nienawiści do wiary katolickiej. Do końca wytrwał w wierze, choć spodziewano się, że zaprze się jej. Do św. Andrzeja Boboli można odnieść słowa Apokalipsy: „A oni zwyciężyli dzięki krwi Baranka i dzięki słowu swojego świadectwa i nie umiłowali dusz swych aż do śmierci” – powiedział 16 maja kard. Kazimierz Nycz w sanktuarium św. Andrzeja Boboli.