Parafia św. Antoniego Marii Zaccarii w Warszawie została utworzona 5 lipca 1995 r. dekretem ówczesnego metropolity warszawskiego kard. Józefa Glempa. Liczyła wówczas około 2 tysięcy rodzin.

Pierwszym proboszczem został mianowany o. Kazimierz Lorek, barnabita, który pełnił ten urząd przez 23 lata i jest budowniczym tamtejszej świątyni. Jest też założycielem działającego przy parafii „Domu Chleba” dla bezdomnych.

Przyczynił się do wybudowania przedszkoli językowych - „Dzieciątka Jezus” i „Anioła Stróża” oraz Centrum Kulturalnego Ojców Barnabitów, przy ul. Smoluchowskiego 1. Za działalność na rzecz stolicy, w 2011 r. otrzymał nagrodę Miasta Stołecznego Warszawy.

Obecnie w parafialnej posłudze zastąpił go o. Tomasz Więch. Kard. Kazimierz Nycz mianował go nowym proboszczem 29 kwietnia 2018 r. 6 maja został uroczyście wprowadzony na nowy urząd.

Zgromadzenie Księży św. Pawła - Barnabitów, którego charyzmat ujęto w słowach „”ewangelizować, wychowywać i uświęcać” prowadzi tę warszawską parafię w dekanacie wilanowskim od 1995 r. Kościół został wybudowany w latach 1999-2003 przy ul. Sobieskiego. Świątynia ta jest siódmym kościołem znajdującym się na historycznym warszawskim Trakcie Królewskim.